Параллельно с формированием комплексовTCR-CD3 на поверхности тимоцитов образуются молекулы CD4 и CD8. Молекула CD4 представлена одной белковой цепью, внеклеточная часть которой имеет 4 домена, за ними следует трансмембранный домен и относительно короткий внутриклеточный домен. У человека структурные гены молекулы CD4 расположены в 3-й паре хромосом. Молекула CD8 представляет собой гетеродимер из а – и в-цепей. В каждой из них имеется один внеклеточный домен, затем следуют довольно протяженный (30 аминокислотных остатков в а-цепи и 50 – в в-цепи) связующий (спейсерный) участок, трансмембранный домен и хорошо выраженный цитоплазматический домен. Кодирующие обе цепи гены локализованы во 2-й хромосоме. Внутриклеточные участки молекулы CD4 и а-цепи молекулы CD8 сходны и постоянно связаны с тирозинкиназой p56lck. Из этого следует, что CD4 и CD8 нужны клеткам для передачи внешних сигналов внутрь клетки, но источником этих сигналов являются не чужеродные антигены, а молекулы главного комплекса гистосовместимости антигенпредставляющих клеток. Установлено, что молекула CD4 специфически взаимодействует только с молекулами МНС класса II, а молекула CD8 – только с молекулами МНС класса I.